Fish conservation: importance of DNA reference library based on accurately identified specimens. The case of New Caledonian freshwater fish

Mennesson M.I., Charpin N., Keith P.

Published date: August 2024
Volume: 48
Number: 3
Pagination: 187-193
doi: https://doi.org/10.26028/cybium/2024-014
Notes:

Corresponding author: Marion I. Mennesson, marion.mennesson@mnhn.fr

How to cite: Mennesson, M. I., Charpin, N., & Keith, P. (2024). Fish conservation: importance of DNA reference library based on accurately identified specimens. The case of New Caledonian freshwater fish. Cybium, 48(3): 187-193. https://doi.org/10.26028/CYBIUM/2024-014

Abstract

DNA tools are increasingly used for identifying species, however, successful DNA-based identification requires a reference library of DNA sequences from accurately identified specimens. Here we present a reference library of COI and 12S sequences for New Caledonian freshwater fish. Our library contains 523 MNHN voucher specimens, representing 84 valid species compared to type specimens, including 11 new records. The development of this DNA library will allow managers and researchers to explore the ichthyodiversity of New Caledonia, to manage the species and to promote action or conservation plans. We encourage taxonomists to build and publish molecular libraries linked to species accurately identified and museum voucher specimens.

Keywords: DNA library - FISH - Mitogenome - New Caledonia
French abstract

Une bibliothèque de référence de séquences ADN pour les poissons d’eau douce de Nouvelle-Calédonie basée sur des spécimens identifiés avec précision

Les outils ADN sont de plus en plus utilisés pour l’identification des espèces, cependant, une identification réussie basée sur l’ADN nécessite une bibliothèque de référence de séquences provenant de spécimens identifiés avec précision. Nous présentons ici une bibliothèque de référence de séquences COI et 12S pour les poissons d’eau douce de Nouvelle-Calédonie. Notre bibliothèque contient 523 spécimens de référence déposés au MNHN, représentant 84 espèces valides comparées aux spécimens types dont 11 espèces référencées pour la première fois. Le développement de cette bibliothèque d’ADN permettra aux gestionnaires et aux chercheurs d’explorer l’ichtyodiversité de la Nouvelle-Calédonie, de gérer les espèces et de promouvoir des plans d’action ou de conservation. Nous encourageons les taxonomistes à construire et à publier des bibliothèques moléculaires avec une identification précise des espèces avec des spécimens de référence consultables dans les musées.

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