A student-based expansion of the strategies of reproduction in fish (STOREFISH) database to 288 North American freshwater and anadromous species for 14 egg and larval traits
Corresponding author: Paul A. Venturelli, paventurelli@bsu.edu
How to cite: Venturelli, P. A., & Teletchea S., Bales A.M., Bartolozzi P., Bird A.T., Blevins T.K., Campaniello S.J., Caizergue M., Carlu L., Chancerelle G., Colletta B., Dauphin L., Doche B., Derolf P.M., De Wever T., Dewig E.M., Dixon L.M., Durand C., Eck M., Faatauira T., Fisher S.M., Fix G., Fournier S., Gauthy A., Golitin C., Guyader S., Hachet F., Harnay P., Hawkins S.G., Kaufling A., Khan M., Kesterson W.J., Klein M.K., Lejeune C., Loiseau J., Loyau R., Luginbuhl S.B., Maeso J., Marc T., Martineau L., Meurillon T., Mesnieres E., Mohra R., Mccord A.O., Mcdonald Z.N., Mckay A.B., Miller T., Minhinnett S.R., Poujoulat R., Profit V., Psurny G.Q., Raymond G., Redinger R.R., Rech G., Rider A.L., Rodriguez L., Sanders S.S., Salou G., Saucier T.E., Schwer J.D., Seymour R.D., Seznec C., Shook B.L., Soler J., Tettling L., Thornburg G.E., Tottoli T., Veber E., Verdier L., Verin R., Vigot M., Vigouroux E., Voss K.N., Weir J.L., Teletchea F. (2023). A student-based expansion of the strategies of reproduction in fish (STOREFISH) database to 288 North American freshwater and anadromous species for 14 egg and larval traits. Cybium, 47(3): 315-323. https://doi.org/10.26028/CYBIUM/2023-006
Teleosts exhibit the highest reproductive diversity of all vertebrates, but this diversity has not been extensively analyzed, in part due to a lack of synthesis of life history information. The original STOREFISH (STrategies Of REproduction in FISH) database was published in 2007, and then released online in 2020 to facilitate data visualization and utilization (www.storefish.org). The original database contains information on 50 life history traits from ~1,200 references for 80 freshwater and anadromous species, mostly from Europe. Here, we describe the process and results of an international effort to update and extend the database for 14 egg and larval traits from North American freshwater and anadromous species, and then reassess previous bivari- ate relationships. Students in the United States and France used data from nearly 800 references to increase the STOREFISH database to 8,081 records (70% increase) for 368 species (360% increase) and 41 families (116% increase). We extracted fewer records per species than the original database because we included many species for which relatively little information was known. However, the distribution of records among trait values was similar to the original database. Updating and expanding the database improved the accuracy of the incuba- tion time-temperature relationship below 10°C, and challenged a previous assumption regarding the larval size- egg diameter relationship. Our expansion effort progressed smoothly and quickly via an educational model that emphasized supervised research and collaboration. We are extending this approach to include validators for data curation, and both pure and applied research that demonstrates the utility of the STOREFISH database to biodi- versity research, conservation, assessment, management, and aquaculture.
Extension de la base de données “strategies of reproduction in fish” (STOREFISH) à 288 espèces nord-américaines d’eau douce et anadromes pour 14 caractères d’œufs et de larves
Les téléostéens présentent la plus grande diversité de reproduction des vertébrés, mais cette diversité n’a pas été analysée de manière approfondie, en partie en raison d’un manque de synthèse de leurs traits d’histoire de vie. La base de données STOREFISH (STrategies Of REproduction in FISH) a été publiée en 2007, puis mise en ligne en 2020 pour faciliter la visualisation et l’utilisation des données (www.storefish.org). La version initiale contient des informations pour 50 traits d’histoire de vie à partir de l’analyse d’environ 1 200 références pour 80 espèces d’eau douce et anadromes - principalement d’Europe. Nous décrivons ici le processus et les résultats d’un effort international visant à mettre à jour et à étendre la base de données pour 14 traits d’œufs et de larves d’espèces d’eau douce et anadromes d’Amérique du Nord, puis à réévaluer les relations bivariées précédentes. Des étudiants aux États-Unis et en France ont utilisé les données de près de 800 références pour augmenter la base de données STOREFISH à 8 081 enregistrements (augmentation de 70%) pour 368 espèces (augmentation de 360%) et 41 familles (augmentation de 116%). Nous avons extrait moins de données par espèce que la base de données originale parce que nous avons inclus ici de nombreuses espèces pour lesquelles relativement peu d’informations sont disponibles. Cependant, la distribution des données parmi les valeurs de trait était similaire à la base de données d’origine. La mise à jour et l’expansion de la base de données ont amélioré la précision de la relation temps d’incubation-température en dessous de 10°C et remis en question une hypothèse antérieure concernant la relation taille des larves-diamètre des œufs. Notre effort d’extension a progressé en douceur et rapidement grâce à un modèle éducatif qui mettait l’accent sur la recherche supervisée et la collaboration. Nous allons poursuivre cette approche pour inclure des contrôles pour vérifier l’encodage des données, et l’étendre à la recherche pure et appliquée qui ont démontré l’utilité de STOREFISH dans les études sur la biodiversité, la conservation, l’évaluation, la gestion de la nature et l’aquaculture.