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First DNA barcodes of two endemic fishes from the Maros karst region, South Sulawesi, Indonesia
Corresponding authors: Andi Aliah Hidayani, aliah@fikp.unhas.ac.id; Abigail Mary Moore, abigail@pasca.unhas.ac.id
How to cite: Hidayani, A. A., Tassaka, A. C. M. A. R., Kadir, N. N., Yasir, I., Jompa, J., Umar, W., Litaay, M., Parenrengi, A., Ndobe, S., Gani, A., Putri, A. P., Iqram, M., Omar, S. B. A., & Moore, A. M. (2024). First DNA barcodes of two endemic fishes from the Maros karst region, South Sulawesi, Indonesia. Cybium, 48(3): 247-250. https://doi.org/10.26028/CYBIUM/2024-015
Sulawesi is the largest island in the Wallacea biodiversity hotspot. However, data on the ichthyofauna of this island are incomplete, and several known species do not have reference DNA barcodes in public databases; these are necessary, inter alia, to enable non-invasive environmental DNA detection. As a contribution towards filling this gap, specimens of two species endemic to South Sulawesi were collected from the Maros karst region in March 2023: Dermogenys orientalis and Lagusia micracanthus. Right pectoral fins were preserved in 96% ethanol for DNA barcoding before preservation of three voucher specimens from each species at Hasanuddin University. DNA extraction and PCR (COI mitochondrial genetic marker) was followed by Sanger sequencing. Data analysis was conducted in MEGA 11. These first barcodes were deposited in GenBank: Dermogenys orientalis accessions OR829330- OR829332 and Lagusia micracanthus accessions OR829336-OR829336. Phylogenetic trees were constructed using homologous sequences obtained through the NCBI GenBank BLASTn routine.
Premiers barcodes ADN de deux poissons endémiques de la région karstique de Maros, Sulawesi du Sud, Indonésie
Sulawesi est la plus grande île du hotspot de biodiversité de Wallacea. Cependant, les données sur l’ichtyofaune de cette île sont incomplètes, et plusieurs espèces connues n’ont pas de barcode ADN de référence dans les bases de données publiques ; ceux-ci sont nécessaires, entre autres, pour permettre la détection non-invasive utilisant l’ADN environnemental. Pour contribuer à remédier à ce manque, des spécimens de deux espèces endémiques dans le Sulawesi du sud ont été collectés dans la région karstique de Maros en mars 2023 : Dermogenys orientalis et Lagusia micracanthus. Les nageoires pectorales droites ont été conservées dans de l’éthanol à 96% pour le Barcoding de l’ADN avant la conservation de trois spécimens de référence de chaque espèce à l’Université Hasanuddin. L’extraction d’ADN et la PCR (marqueur génétique mitochondrial COI) ont été suivies du séquençage Sanger. L’analyse des données a été réalisée dans MEGA 11. Ces premiers codes-barres ont été déposés dans le GenBank:accessions Dermogenys orientalis OR829330-OR829332 et accessions Lagusia micracanthus OR829336- OR829336. Des arbres phylogénétiques ont été construits avec des séquences homologues obtenues via la routine BLASTn du NCBI GenBank.
