Réalisée en Nouvelle-Calédonie après le passage du cyclone Erica, la présente étude a pour but de comparer les caractéristiques générales et la structure des communautés des poissons de trois récifs coralliens dont le statut de protection diffère. La richesse spécifique, la densité et la biomasse des familles de poissons d’intérêt commercial dans la région Pacifique et des espèces commercialisées en Nouvelle-Calédonie ont été estimées par comptage visuel en plongée. Pour l’ensemble des espèces d’intérêt commercial, la comparaison des trois récifs montre que ces indices ne présentent pas de différence significative. Pour les espèces commercialisées, la comparaison des indices globaux confirme les effets attendus des mesures de protection (pêche interdite), à savoir des valeurs significativement plus importantes dans la réserve, soit respectivement +15% et +28% pour la richesse spécifique, +65% et +107% pour la densité et +94% et +158% pour la biomasse. La même tendance est observée au niveau des principales familles commerciales (Serranidae, Siganidae, Acanthuridae commerciaux et Labridae commerciaux). En revanche, les effets de protection sont plus nuancés en ce qui concerne les Scaridae, pour lesquels seules quelques espèces à forte valeur ajoutée, dont Chlorurus microrhinos, ont une densité et une biomasse significativement plus importante dans la réserve. L’analyse de la structure des peuplements (AFC) a révélé l’existence de 3 assemblages de poissons (un groupe de stations touchées par le cyclone, un groupe réserve et un groupe non réserve) qui s’avèrent n’être que partiellement liés aux caractéristiques du substrat s’ils sont comparés aux résultats d’une analyse sous contrainte (ACC). Cette étude a donc montré que la mise en réserve induit des modifications de la structure des populations de poissons d’intérêt commercial, bien que les caractéristiques du substrat restent un facteur structurant majeur dans leur organisation. Enfin, il a été montré que la densité des espèces commerciales dans les zones non protégées, proches de la réserve, est plus importante qu’elle ne l’était dans la réserve avant la mise en oeuvre de moyens de protection. Ces résultats, ainsi que le relatif maintien des peuplements observé depuis 9 ans dans la réserve, permettent d’émettre l’hypothèse d’interactions significatives entre les zones protégées et non protégées proches.