The complete mitochondrial genome of Thymallus thymallus (Linnaeus, 1758) (Actinopterygii, Salmonidae) obtained by long range PCRs and double multiplexing

Denys G.P.J., Secci-Petretto G., Gomes-Dos-Santos A.

Published date: June 2020
Volume: 44
Number: 2
Pagination: 091-094
Publisher: Société Française d’Ichtyologie
doi: https://doi.org/10.26028/cybium/2020-442-001
Notes:

Corresponding author: Gaël P.J. Denys, gael.denys@mnhn.fr

Abstract

The complete mitochondrial DNA sequence of Thymallus thymallus (Actinopterygii, Salmonidae) from a museum voucher caught in the Ain River (Rhône drainage) was sequenced. The sequence was 16 660 bp in length, consisted of 13 protein-coding genes, 22 transfer RNA genes including 2 tRNA-Leu and 2 tRNA-Ser, 2 ribosomic RNA genes and the control region. Intergenic space and overlapping sequences were found. The base composition of the whole mtDNA was 27.5% A, 27.9% T, 27.1% C and 17.5% G. This mitogenome was sequenced for less than 20 euros.

Keywords: Long PCR - Mitogenome - Sample multiplexing - Thymallus thymallus
French abstract

Le génome mitochondrial complet du Thymallus thymallus (Linnaeus, 1758) (Actinopterygii, Salmonidae) obtenu par PCRs longues et double multiplexage

 

Le génome mitochondrial complet de Thymallus thymallus (Actinopterygii, Salmonidae) provenant d’un voucher enregistré en collection et capturé dans l’Ain (bassin du Rhône) a été séquencé. La séquence d’une longueur de 16 660 pb, contient 13 gènes codants, 22 ARN de transfert dont 2 ARNt-Leu et 2 ARNt-Ser, 2 gènes ARN ribosomiques et la région de contrôle. Un espace intergénique et des séquences se chevauchant ont été trouvés. La composition des bases du mitogénome est de 27,5% A, 27,9% T, 27,1% C et 17,5% G. Ce mitogénome a été séquencé pour moins de 20 euros

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